Het water van Fly Creek stroomt van Battle Mountain in het zuiden van Wyoming en mondt uit in de Little Snake River bij de bovenloop in Routt County. Het water danst vervolgens langs de grens tussen Colorado en Wyoming, huppelt van de ene staat naar de andere, door county's en ravijnen, voordat het naar het zuiden afstroomt in de machtige Yampa River die door Dinosaur National Monument en verder stroomt.