El agua de Fly Creek drena desde Battle Mountain en el sur de Wyoming y fluye hacia el río Little Snake cerca de sus nacientes en el condado de Routt. Luego el agua baila a lo largo de la frontera entre Colorado y Wyoming, saltando de un estado a otro, pasando por condados y cañones, antes de descender hacia el poderoso río Yampa para atravesar el Monumento Nacional Dinosaur y más allá.